Амідаза (AMD)
Ферменты:З'яўляюцца макрамалекулярнымі біялагічнымі каталізатарамі, большасць ферментаў - гэта бялкі
Амідаза:Каталізуюць гідроліз розных эндагенных і чужародных аліфатычных і араматычных амідаў шляхам пераносу ацыльнай групы ў ваду з утварэннем свабодных кіслот і аміяку. Гідраксамавыя кіслоты і іншыя арганічныя кіслоты шырока выкарыстоўваюцца ў якасці лекаў, паколькі яны з'яўляюцца кампанентамі фактараў росту, антыбіётыкаў і інгібітараў пухлін. Амідазы можна падзяліць на ацылазы R-тыпу і S-тыпу ў залежнасці ад стэрэаселектыўнасці каталізатара.
Акрамя каталізу гідролізу амідаў, амідаза таксама можа каталізаваць рэакцыі пераносу ацылу ў прысутнасці косубстратаў, такіх як гідраксіламін.
Амідазы з розных крыніц маюць розную субстратную спецыфічнасць, некаторыя з іх могуць гідралізаваць толькі араматычныя аміды, некаторыя - толькі аліфатычныя аміды, а некаторыя - α- або ω-амінааміды. Большасць амінаў маюць добрую каталітычную актыўнасць толькі для ацыклічных або простых араматычных амідаў, але для складаных араматычных злучэнняў гетэрацыклічныя аміды, асабліва аміды з орта-замяшчальнікамі, звычайна маюць нізкую актыўнасць (толькі некалькі ферментаў праяўляюць лепшыя каталітычныя эфекты).
Каталітычны механізм:
| Ферменты | Код прадукту | Код прадукту |
| Ферментны парашок | ES-AMD-101~ ES-AMD-119 | набор з 19 амідаз, па 50 мг кожная, 19 прадметаў * 50 мг / прадмет, або іншая колькасць |
| Набор для скрынінгу (SynKit) | ES-AMD-1900 | набор з 19 амідаз, па 1 мг кожная 19 прадметаў * 1 мг / прадмет |
★ Высокая субстратная спецыфічнасць.
★ Моцная хіральная селектыўнасць.
★ Высокая эфектыўнасць пераўтварэння.
★ Менш пабочных прадуктаў.
★ Мяккія ўмовы рэакцыі.
★ Экалагічна чысты.
➢ Скрынінг ферментаў варта праводзіць для канкрэтных субстратаў з-за спецыфічнасці субстрата і выбіраць фермент, які каталізуе мэтавы субстрат з найлепшым каталітычным эфектам.
➢ Ніколі не кантактуйце з экстрэмальнымі ўмовамі, такімі як: высокая тэмпература, высокі/нізкі pH і арганічныя растваральнікі высокай канцэнтрацыі.
➢ Звычайна рэакцыйная сістэма павінна ўключаць субстрат, буферны раствор (аптымальны pH рэакцыі фермента). У сістэме рэакцыі пераносу ацылу павінны прысутнічаць косубстраты, такія як гідраксіламін.
➢ AMD варта дадаваць апошнім у рэакцыйную сістэму з аптымальным pH і тэмпературай рэакцыі.
➢ Усе віды AMD маюць розныя аптымальныя ўмовы рэакцыі, таму кожны з іх варта дадаткова вывучыць асобна.
Прыклад 1(1):
Гідролізная актыўнасць у адносінах да розных амідных субстратаў
| Субстрат | Канкрэтная дзейнасць мкмоль мін-1mg-1 | Субстрат | Канкрэтная дзейнасць мкмоль мін-1mg-1 |
| Ацэтамід | 3.8 | ο-OH бензамід | 1.4 |
| Прапіёнамід | 3.9 | p-OH бензамід | 1.2 |
| Лактамід | 12.8 | ο-НГ2бензамід | 1.0 |
| Буцірамід | 11.9 | p-НГ2бензамід | 0,8 |
| Ізабутырамід | 26.2 | ο-Талуамід | 0,3 |
| Пентанамід | 22.0 | p-Талуамід | 8.1 |
| Гексанамід | 6.4 | Нікацінамід | 1.7 |
| Цыклагексанамід | 19,5 | Ізанікацінамід | 1.8 |
| Акрыламід | 10.2 | Пікалінамід | 2.1 |
| Метакрыламід | 3.5 | 3-фенілпрапіёнамід | 7.6 |
| Пралінамід | 3.4 | Індол-3-ацетамід | 1.9 |
| Бензамід | 6.8 |
Рэакцыю праводзілі ў 50 мМ буферным растворы фасфату натрыю, pH 7,5, пры тэмпературы 70 ℃.
| Аміды | Гідраксіламін | Гідразін |
| Ацэтамід | 8.4 | 1.4 |
| Прапіёнамід | 18,4 | 3.0 |
| Ізабутырамід | 25,0 | 22,7 |
| Бензамід | 9.2 | 6.1 |
Рэакцыю праводзілі ў 50 мМ буферным растворы фасфату натрыю, pH 7,5, пры тэмпературы 70 ℃.
Роднасная канцэнтрацыя рэагентаў: аміды, 100 мМ (бензамід, 10 мМ); гідраксіламін і гідразін, 400 мМ; фермент 0,9 мкМ.
Прыклад 2(2):
Прыклад 3(3):
1. D'Abusco AS, Ammendola S. і інш. Экстрэмафілы, 2001, 5:183-192.
2. Го Ф.М., Ву Дж.П., Ян Л.Р. і інш. Працэсная біяхімія, 2015, 50(8): 1400-1404.
3. Чжэн Р.К., Цзінь Дж.К., Ву З.М. і інш. Біяарганічная хімія, 2017, даступна ў Інтэрнэце 7.
